• a bioengenharia – que é focada em questões científicas da área biológica solucionadas por métodos de engenharia;
• a engenharia médica – voltada ao projeto e o desenvolvimento de instrumentação (sensores, sistemas de estimulação elétrica, dentre outros) para aplicação médica;
• a engenharia de reabilitação – cujo objetivo é desenvolver instrumentação e procedimentos com finalidade terapêutica para pacientes com deficiência (motora, cognitiva, sensorial);
• e a engenharia clínica – que é focada nas atividades de gestão de tecnologias de saúde, certificação e ensaios de equipamentos médicos, assessoria na aquisição de equipamentos médicos, dentre outras atividades desenvolvidas nos hospitais, clínicas e unidades assistenciais de saúde.

A atuação do engenheiro na área de engenharia biomédica pode se dar em diferentes setores, por exemplo: no ambiente hospitalar, auxiliando nas tomadas de decisões sobre incorporação de novas tecnologias, na gestão do parque tecnológico das unidades de saúde e na manutenção dos equipamentos odonto-médico-hospitalares; no governo, atuando principalmente em agências reguladoras (como ANVISA) e órgãos públicos diretamente ligados à área de saúde (Ministério e Secretarias), podendo auxiliar na elaboração de políticas públicas que envolvam o uso de tecnologia médica; na indústria, desenvolvendo equipamentos veterinários e odonto-médico-hospitalares; e na academia, onde o engenheiro biomédico atua em projetos de pesquisa multidisciplinares com alto potencial de aplicação/translação na/para a área de saúde.

Na UNICAMP, desde a década de 70, projetos nas diferentes áreas da Engenharia Biomédica têm sido desenvolvidos na FEEC com uma forte interação com o Centro de Engenharia Biomédica (CEB). As principais linhas de pesquisa atuais incluem trabalhos envolvendo gerenciamento da tecnologia médico-hospitalar, estimulação elétrica do coração (instrumentação e experimentação), estudos experimentais relacionados ao transporte e regulação do cálcio celular, instrumentação biomédica aplicada ao ultrassom diagnóstico e terapêutico, estudos sobre a neuromecânica do movimento humano, novas tecnologias de próteses neurais e neurociência teórica/computacional.